از آن‌جا که نقشبندیکا در پی آن است تا به تدریج و در آینده، به مرکزی علمی برای مطالعات نقشبندیه‌پژوهی در دامنه‌ای گسترده از جغرافیای جهان اسلام تبدیل شود، رویکرد آن عمدتاً انتقادی با زمینه‌شناسی تاریخی و بر پایۀ مستندات، متون کهن و نسخ خطی، در کنار به کار بردن روش تحلیلی است.
